Значит проблема в дллной организации программы.
Я бы попробовал выкинув LazControl посмотреть будет ли Themes в зависимостях проблемного плагина? если нет, то явно в uses плагина указать Themes проблема возникнет снова? Поотлаживать - конкретезировать место и причину проблемы, может можно будет обойти небольшим патчиком.
В транк компилятора слили ветку с поддержкой пакетов. Я не пробовал, но может уже можно пробовать делать по правильному, на пакетах?